주인공 쵸소란은 어느날 강시에 습격당한다. 그 절체절명의 위기를 구한 것은 한 소녀. 손에 든 부엌칼로 적을 쓰러뜨린 것을 보면서 안도하는 소란에, 소녀는 "이 혼란에 스스로 맞서라"라는 말과 함께 그곳을 떴다. 후일, 학교에 등교한 소란의 앞에 그 소녀는 다시 나타났다. 이 순간으로부터, 쵸소란의 기묘한 운명이 움직이기 시작한다.
어디선가 갑자기 나타나는 이형의 괴물인 이단자들을 쓰러트릴 수 있는 자들인 구세주의 육성을 위해 전생의 기억을 가진 인간들이 모인 "아카네 학원(亜鐘学園)". 여기서 2가지의 최강의 전생을 가진 소년인 하이무라 모로하가 전생 때 만난 소녀들과 다시 만난다.
전생에서 사랑을 맹세했던 공주 검사로 친동생이었던 기억을 지닌 소녀 란죠 ...